Het is mogelijk om in te loggen zonder dat je telkens je wachtwoord moet ingeven met public key authentication (zie https://www.ssh.com/ssh/public-key-authentication). Dit maakt het ook mogelijk om automatisch in te loggen. Dit zou bijvoorbeeld gedaan kunnen worden zoals GitHub dit doet, met een form waarbij je je SSH public key kan uploaden. Een andere mogelijkheid is om een bestand genaamd .ssh/authorized_keys te uploaden, waarin een lijst van public keys staan die toegelaten worden.